Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b2Q3UJB0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b2Q3UJB0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b2Q3UJB0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms