Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHU5

Mtcl1, Microtubule cross-linking factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtcl1Q3UHU5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mtcl1Q3UHU5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mtcl1Q3UHU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Mtcl1Q3UHU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mtcl1Q3UHU5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms