Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx27Q3UHD6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx27Q3UHD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx27Q3UHD6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms