Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnrc6cQ3UHC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnrc6cQ3UHC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms