Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc177Q3UHB8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc177Q3UHB8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms