Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mcrip1Q3UGS4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mcrip1Q3UGS4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms