Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rnf180Q3U827 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf180Q3U827 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rnf180Q3U827 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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