Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q3U595 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q3U595 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q3U595 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q3U595 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q3U595 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q3U595 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q3U595 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q3U595 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms