Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gse1Q3U3C9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gse1Q3U3C9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gse1Q3U3C9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms