Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vars2Q3U2A8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vars2Q3U2A8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vars2Q3U2A8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vars2Q3U2A8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms