Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ankrd33bQ3U0L2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ankrd33bQ3U0L2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd33bQ3U0L2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms