Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hhla1Q3TYV2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hhla1Q3TYV2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hhla1Q3TYV2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms