Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccndbp1Q3TVC7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccndbp1Q3TVC7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms