Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Q3TTL0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q3TTL0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms