Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp39Q3TIX9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp39Q3TIX9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp39Q3TIX9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms