Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc13Q3TIR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc13Q3TIR1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc13Q3TIR1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms