Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RubcnlQ3TD16 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RubcnlQ3TD16 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RubcnlQ3TD16 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms