Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnfaip8l3Q3TBL6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms