Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zbtb38Q3LR78 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zbtb38Q3LR78 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zbtb38Q3LR78 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms