Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnnm3Q32NY4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnnm3Q32NY4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnnm3Q32NY4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnnm3Q32NY4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnnm3Q32NY4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnnm3Q32NY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cnnm3Q32NY4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms