Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col24a1Q30D77 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col24a1Q30D77 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col24a1Q30D77 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms