Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rspo3Q2TJ95 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rspo3Q2TJ95 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rspo3Q2TJ95 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms