Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chrna5Q2MKA5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna5Q2MKA5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna5Q2MKA5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms