Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam178bQ24JP3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fam178bQ24JP3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam178bQ24JP3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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