Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpne9Q1RLL3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpne9Q1RLL3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cpne9Q1RLL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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