Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptcd3Q14C51 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ptcd3Q14C51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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