Protein–RNA interactions for Protein: Q14BE7

Fam47c, Family with sequence similarity 47, member A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47cQ14BE7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Fam47cQ14BE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam47cQ14BE7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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Fam47cQ14BE7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms