Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q149G0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q149G0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q149G0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q149G0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q149G0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q149G0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q149G0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q149G0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q149G0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q149G0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q149G0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q149G0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q149G0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q149G0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms