Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp2b3Q0VF55 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2b3Q0VF55 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms