Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam83bQ0VBM2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam83bQ0VBM2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam83bQ0VBM2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms