Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Lrriq1Q0P5X1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Lrriq1Q0P5X1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Lrriq1Q0P5X1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Lrriq1Q0P5X1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.97
Lrriq1Q0P5X1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.97
Lrriq1Q0P5X1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lrriq1Q0P5X1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Lrriq1Q0P5X1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms