Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Vps8Q0P5W1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Vps8Q0P5W1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vps8Q0P5W1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms