Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Neurl1bQ0MW30 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Neurl1bQ0MW30 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms