Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
1700061G19RikQ08EE8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
1700061G19RikQ08EE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms