Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kcnma1Q08460 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kcnma1Q08460 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnma1Q08460 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms