Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Calb2Q08331 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Calb2Q08331 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Calb2Q08331 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms