Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
F13bQ07968 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
F13bQ07968 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
F13bQ07968 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms