Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SrstQ06666 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SrstQ06666 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms