Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fmn1Q05860 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fmn1Q05860 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Fmn1Q05860 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fmn1Q05860 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fmn1Q05860 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Fmn1Q05860 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fmn1Q05860 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms