Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hspg2Q05793 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hspg2Q05793 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms