Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoc2Q05020 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apoc2Q05020 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms