Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sox12Q04890 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox12Q04890 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox12Q04890 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sox12Q04890 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox12Q04890 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox12Q04890 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox12Q04890 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sox12Q04890 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.5 ms