Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sox9Q04887 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sox9Q04887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sox9Q04887 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms