Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nf1Q04690 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nf1Q04690 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms