Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kcnb1Q03717 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kcnb1Q03717 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnb1Q03717 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms