Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Runx1Q03347 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Runx1Q03347 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms