Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdk7Q03147 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdk7Q03147 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms