Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col6a2Q02788 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col6a2Q02788 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms