Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zfp39Q02525 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zfp39Q02525 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms