Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Pdcd1Q02242 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pdcd1Q02242 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms